ترتبط دائرة أمانة سر المجالس ارتباطًا مباشراً برئيس الجامعة، وتتولى القيام بتنظيم وتوثيق ومتابعة تنفيذ القرارات التي تتّخذها المجالس الرئيسيّة في الجامعة واللّجان المنبثقة عنها والمبيّنة تاليًا: المجالس: ·        مجلس الأمناء. ·        مجلس العمداء. ·        مجلس الجامعة. ·        مجلس إدارة صندوق دعم الطلبة. اللّجان: ·        اللّجنة الماليّة والإداريّة. ·        لجنة التدقيق الداخلي. ·        اللّجنة الأكاديميّة. ·        لجنة تنمية الموارد. ·        أيّ لجنة أخرى بتكليف من الرئيس. المهام: ·        المشاركة في إعداد وتنظيم أنظمة الجامعة والتّعليمات المنبثقة عنها. ·        تنظيم وإعداد وتوثيق اجتماعات المجالس الرئيسيّة.  ·        إعداد قرارات المجالس واللّجان المنبثقة عنها ومتابعة تنفيذها بالتنسيق مع الرئيس. ·        متابعة منح صندوق دعم الطلبة واتّفاقيّات المنح الخارجيّة مع عمادة شؤون الطلبة ومكتب المنح واستقطاب التمويل. ·        إعداد ومتابعة المراسلات الرسميّة للمجالس المختلفة. ·        متابعة ترقية أعضاء هيئة التدريس مع رئيس الجامعة. ·        أيّة أمور أخرى بتكليف من الرئيس.